MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium acidurici 9a plasmid pCuri3

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018657	ATT	2	6	22	27	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018657	TTAT	2	8	28	35	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018657	GGT	2	6	89	94	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018657	TAT	2	6	188	193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472017
5	NC_018657	ACT	2	6	224	229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472017
6	NC_018657	TAA	2	6	232	237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472017
7	NC_018657	ATAA	2	8	260	267	75 %	25 %	0 %	0 %	407472017
8	NC_018657	TA	3	6	311	316	50 %	50 %	0 %	0 %	407472017
9	NC_018657	ATT	2	6	347	352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472017
10	NC_018657	ATA	2	6	387	392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472017
11	NC_018657	ATA	2	6	399	404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472017
12	NC_018657	A	6	6	406	411	100 %	0 %	0 %	0 %	407472017
13	NC_018657	CAAT	2	8	415	422	50 %	25 %	0 %	25 %	407472017
14	NC_018657	GCA	2	6	556	561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407472017
15	NC_018657	ATG	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472017
16	NC_018657	TCA	2	6	577	582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472017
17	NC_018657	TTAACA	2	12	584	595	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407472017
18	NC_018657	TAA	2	6	757	762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472017
19	NC_018657	AT	3	6	776	781	50 %	50 %	0 %	0 %	407472017
20	NC_018657	ATG	2	6	816	821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472017
21	NC_018657	AGA	2	6	904	909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472017
22	NC_018657	A	6	6	921	926	100 %	0 %	0 %	0 %	407472017
23	NC_018657	ACT	2	6	934	939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472017
24	NC_018657	TAA	2	6	958	963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472017
25	NC_018657	TGA	2	6	1063	1068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472017
26	NC_018657	GAA	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472017
27	NC_018657	ATG	2	6	1203	1208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472017
28	NC_018657	GTGA	2	8	1250	1257	25 %	25 %	50 %	0 %	407472017
29	NC_018657	AGA	2	6	1264	1269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472017
30	NC_018657	GAT	2	6	1280	1285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472017
31	NC_018657	TAT	2	6	1354	1359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018657	TAT	2	6	1368	1373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018657	TA	3	6	1384	1389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018657	TTAT	2	8	1400	1407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018657	CAT	2	6	1421	1426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018657	T	6	6	1484	1489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018657	T	6	6	1531	1536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018657	GTT	2	6	1585	1590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018657	TAT	2	6	1595	1600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472018
40	NC_018657	TAA	2	6	1657	1662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472018
41	NC_018657	TTCG	2	8	1694	1701	0 %	50 %	25 %	25 %	407472018
42	NC_018657	T	7	7	1736	1742	0 %	100 %	0 %	0 %	407472018
43	NC_018657	GAA	2	6	1788	1793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472018
44	NC_018657	AGG	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407472018
45	NC_018657	GGT	2	6	1896	1901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407472018
46	NC_018657	T	6	6	1920	1925	0 %	100 %	0 %	0 %	407472018
47	NC_018657	TGA	2	6	1988	1993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472018
48	NC_018657	GA	3	6	2013	2018	50 %	0 %	50 %	0 %	407472018
49	NC_018657	TGA	2	6	2027	2032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472018
50	NC_018657	TGA	2	6	2057	2062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472018
51	NC_018657	TTGA	2	8	2079	2086	25 %	50 %	25 %	0 %	407472018
52	NC_018657	AGA	2	6	2111	2116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472018
53	NC_018657	A	6	6	2129	2134	100 %	0 %	0 %	0 %	407472018
54	NC_018657	AGG	2	6	2153	2158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407472018
55	NC_018657	GTA	2	6	2341	2346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472019
56	NC_018657	A	6	6	2514	2519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018657	CTTTT	2	10	2529	2538	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018657	T	6	6	2571	2576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018657	AAC	2	6	2608	2613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018657	CTTTC	2	10	2621	2630	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_018657	A	6	6	2657	2662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018657	TCGT	2	8	2691	2698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018657	TA	3	6	2700	2705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018657	TTTA	2	8	2709	2716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018657	AAT	2	6	2734	2739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018657	A	8	8	2775	2782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018657	TCT	2	6	2789	2794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018657	TTG	2	6	2795	2800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018657	T	7	7	2805	2811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018657	AGA	2	6	2822	2827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018657	AT	3	6	2844	2849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018657	ATT	2	6	2865	2870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.